科學(xué)家開發(fā)出人類細(xì)胞分裂的蛋白質(zhì)互作模型

2018年9月19日 訊  --有絲分裂是（即細(xì)胞一分為二）有機(jī)體生命的基礎(chǔ)過程，近日，一項刊登在國際雜志Nature上的研究報告中，來自歐洲分子生物學(xué)實驗室的科學(xué)家們通過研究繪制出了促進(jìn)細(xì)胞分裂的首張蛋白質(zhì)互作圖譜，其能夠幫助研究人員有效追蹤推動細(xì)胞分類過程的特殊蛋白的位置和種類。
2010年，研究人員通過研究鑒別出了負(fù)責(zé)人類細(xì)胞分裂的關(guān)鍵人類基因組區(qū)域，但細(xì)胞并不會依靠基因組DNA來運(yùn)行，其依賴于DNA所編碼的蛋白質(zhì)來運(yùn)行，蛋白質(zhì)能在細(xì)胞中完成大部分工作，從而形成細(xì)胞的“運(yùn)作”水平；諸如有絲分裂等過程需要在時間和空間上與數(shù)百種不同的蛋白質(zhì)緊密協(xié)調(diào)，蛋白質(zhì)通常會以團(tuán)隊形式工作，類似于在大型建筑工地上的專業(yè)建筑工人團(tuán)隊。

研究者Jan Ellenberg說道，截止到目前為止，很多單個實驗室僅能對活細(xì)胞中單一蛋白質(zhì)的作用機(jī)理進(jìn)行研究，這項研究中我們利用了一種特殊的系統(tǒng)性策略，清楚的觀察到了人類活細(xì)胞中形成的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)；隨后研究人員將這些有絲分裂細(xì)胞圖譜中的數(shù)據(jù)整合到了交互式的4-D計算機(jī)模型中，在這種公共資源中，科學(xué)家們就能夠自由選擇有絲分裂蛋白的任意組合，并且實時觀察其在細(xì)胞分類過程中的作用模式。

共享工具制造更多的細(xì)胞圖譜

細(xì)胞分裂是有機(jī)體生命的必要過程，當(dāng)其發(fā)生錯誤時，諸如生育問題和*癥等缺陷就會發(fā)生，除了研究有絲分裂外，研究人員所開發(fā)的新技術(shù)還能用來研究驅(qū)動其它細(xì)胞功能的特殊蛋白，比如細(xì)胞死亡、細(xì)胞遷移，甚至是*細(xì)胞的轉(zhuǎn)移；通過觀察這些蛋白質(zhì)所形成的***絡(luò)，研究人員鑒別出了關(guān)鍵的脆弱點(diǎn)，即只有一種蛋白質(zhì)負(fù)責(zé)將兩項任務(wù)聯(lián)系在一起。

從網(wǎng)絡(luò)的角度來觀察**相關(guān)的過程或許就能為研究人員尋找關(guān)鍵鏈接新的視角，這樣研究人員就能通過切斷或重新連接這些項目來改變其功能，這項研究中研究人員所采用的定量纖顯微鏡平臺和創(chuàng)建動態(tài)蛋白質(zhì)圖譜的代碼就能公開來供其他研究人員所使用。

計算活細(xì)胞中的蛋白

這項研究中，研究人員對在一種廣泛使用的人類*細(xì)胞HeLa細(xì)胞進(jìn)行研究，研究人員利用CRISPR/Cas基因編輯技術(shù)使細(xì)胞中28種對有絲分裂非常重要的蛋白質(zhì)顯現(xiàn)熒光，隨后應(yīng)用3-D共聚焦顯微鏡來追蹤觀察這些細(xì)胞分布在細(xì)胞中的具體位置，這種纖維鏡的敏感性能夠達(dá)到對蛋白質(zhì)進(jìn)行計算，因此研究人員就能夠清楚觀察到特定位點(diǎn)的100、1000或者10000個蛋白質(zhì)，對于所有蛋白質(zhì)而言，這些數(shù)據(jù)都能被整合到一種交互式的計算機(jī)模型中進(jìn)行深入的分析。

人類細(xì)胞中一共有大約600種不同的蛋白質(zhì)參與了有絲分裂的過程，完成共600個蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù)庫或許就能幫助研究人員理解細(xì)胞分類過程中信息的傳遞和擴(kuò)散機(jī)制，以及細(xì)胞進(jìn)行分裂的決策是如何進(jìn)行制定的；研究者Stephanie Alexander表示，以相同的標(biāo)準(zhǔn)化方法來對更多的蛋白質(zhì)進(jìn)行成像就能夠為當(dāng)前的圖譜增加更多的信息，未來研究人員或?qū)⒛芾L制出細(xì)胞中蛋白質(zhì)的全景圖譜，通過該圖譜研究人員就能夠觀察到機(jī)體生命不同過程的發(fā)生機(jī)制，比如細(xì)胞分裂和細(xì)胞死亡等多過程，以及這些過程之間的神秘關(guān)聯(lián)。

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