比較糖蛋白質(zhì)組學鑒定

為了克服這個域存在的技術(shù)限制，在項新的研究中，奧地利科學院分子生物技術(shù)研究所（IMBA）主任Josef Penninger博士及其團隊開發(fā)出質(zhì)譜法和算法，終能夠?qū)碗s的糖結(jié)構(gòu)進行綜合識別，并且將它們繪制到相應糖蛋白的正確位點上。他們新開發(fā)的比較糖蛋白質(zhì)組學（comparative glycoproteomics）平臺于2017年9月20月在線發(fā)表在Nature期刊上，論文標題為“Comparative glycoproteomics of stem cells identifies new players in ricin toxicity”。論文第作者為IMBA研究員Jasmin Taubenschmid博士和IMBA蛋白質(zhì)組研究員Johannes Stadlmann。他們的方法被稱作為SugarQb（Sugar Quantitative Biology），能夠獲得對生物系統(tǒng)中的蛋白糖基化和聚糖修飾的全局性認識。他們將這種平臺應用于兩項概念驗證研究---對胚胎干細胞糖蛋白質(zhì)組進行分析和鑒定出毒性產(chǎn)生所必需的糖蛋白---中。

利用這種新的SugarQb方法，這些研究人員次繪制出小鼠和人胚胎干細胞糖蛋白質(zhì)組草圖。他們的研究結(jié)果幾乎將所有已知的糖蛋白的數(shù)量增加了倍。他們也揭示出多種新的糖基化蛋白，這些糖基化蛋白包括進化上保守的糖修飾，以及小鼠和人干細胞多能性因子中的物種特異性糖修飾。他們發(fā)現(xiàn)的很多這樣的糖基化蛋白位于細胞膜上，而且參與細胞間信號轉(zhuǎn)導、細胞相互作用和胚胎發(fā)育。

SugarQb方法可以免費給所有的科學們。Stadlmann說，“我們希望我們的平臺將讓各地的研究團隊通過識別糖結(jié)構(gòu)和它們在相應蛋白上的位置來開拓這個未知的域?！?Penninger補充道，“糖基化在包括*癥在內(nèi)中發(fā)揮著重要的作用。SugarQb方法將讓科學們揭示新的生物學機制。它可能也被臨床醫(yī)師用來確定異常的糖蛋白質(zhì)組特征為生物標志物和追蹤作出的反應。

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